Đưa dung môi phản ứng vào bình qua van thông hơi để rửa trôi phần lớn cặn; sau đó, đổ nước vào nửa bình và khuấy trong 10 phút. Chỉ khi đó nắp bình mới được mở để làm sạch các thành bên trong.
Trong quá trình làm sạch, nắp và van lấy mẫu phải được làm sạch và phải thực hiện xả nitơ trong thời gian ngắn khi nước vẫn còn bên trong bình.
Đối với lò phản ứng không được sử dụng trong một thời gian, tốt nhất nên đổ đầy ethanol khan sạch đến 70% công suất để ngâm; các bu lông không cần phải siết chặt.
Vệ sinh đúng cách đảm bảo lò phản ứng áp suất cao sẵn sàng cho lần sử dụng tiếp theo.